Pero los problemas para el reino Seleucida no habían hecho sino comenzar. Como recordaran, Antioco IV había sucedido a su hermano Seleuco, pero este tenia un hijo llamado Demetrio, y para los seguidores de este, Antioco IV era un usurpador que le había quitado el trono al legitimo heredero, conocido como Demetrio I.
Y se inicio la guerra civil entre Lisias y el pequeño Amtioco V por un lado, y Demetrio I por el otro, resultando ganador Demetri I.
Los Judios no quedaron inmunes a esta conflicto. Mientras Judas Macabeo estaba en las montañas, Demetrio volvió a la política de nombrar a un Sumo Sacerdote filoheleno, y este nombramiento recayó en un tal Eliakim, que adopto el nombre griego de Alcimo. Resulto ser que este Alcimo era de la familia descendiente de Sadoc, es decir, un saduceo, y por lo tanto descendiente del linaje de los sacerdotes del templo desde el rey Salomón.
El problema para Judas Macabeo fue que los hassidin, preocupados por la religión, se sintieron satisfechos con la vuelta de un saduceo a la jefatura de El templo, y abandonaron la lucha.
Pero Judas no se amilanò, e intento una jugada diplomática, busco de pactar con Roma. Demetrio I ataco con su ejercito a los Macabeos en el año 161 AC, previniendo una escalada del conflicto con la entrada de los temidos romanos, y logro una victoria contra Judas y sus pocos partidarios en ese momento, dando muerte al guerrero Macabeo.
Pero aun quedaban Jonatan, Simeón y Juan Macabeos. Jonatan se dirigió hacia el desierto del sur de Judá, y siguió la lucha.
Demetrio I, cansado de tanta lucha estéril, y con suficientes problemas en Mesopotamia con los Partos, que habían ocupado la parte de Iran que se conocía como Media, y asediaban a la helenizada tierra "entre ríos", prefirió ofrecerle a Jonatan la gobernación de Jerusalén.
Nuevamente entraron las tropas macabeas a la ciudad santa de los judíos.
Pero el asunto dinástico seleucida estaba muy lejos de solucionarse. Apareció otro pretendiente al trono, un tal Alejandro Balas, que decía ser hijo de Antioco IV, y esta vez apoyado por Tolomeo de Egipto (sin duda detrás estaba Roma, el protector de Egipto).
Jonatan decidió apoyar a Alejandro Balas, ya que realmente los judíos de Jerusalén habían sido aliados de Egipto, donde estaba una numerosa colonia judía en Alejandría, durante muchos años, antes de ser conquistados por los Seleucidas.
Jonatan envió a su hermano Juan para contactar a los nabateos (árabes) para que se unieran a su causa, y en el camino fue muerto. Solo quedaban Jonatan y Simón Macabeos.
Empezo un nuevo juego diplomático, Demetrio le ofreció mas tierras a Jonatan, cuyo reino era realmente Judea, es decir, los alrededores de Jerusalén, y Alejandro Balas le ofreció el Sumo Sacerdocio.
Jonatan acepto las dos ofertas, expandio su reino, y fue nombrado Sumo Sacerdote del templo, acabando con la larga dinastía de los descendientes de Sadoc, y siendo Principe de Juda (nunca se corono rey) y Sumo Sacerdote a la vez.
En esta época fue que se completo el Libro de Daniel, ese libro tomado como profético, pero que narro eventos pasados, como propaganda para los eventos que estaban aconteciendo, con el renacer de la independencia judía.
Es importante recalcar, judía, no israelita, el reino de Israel había muerto hacia siglos, y jamás se recupero. Hablamos de Judea y su capital Jerusalén, y la dinastía prometida o mesiánica era la dinastía de David, rey de Judea, que llego a serlo también de Israel, otro reino yahvista.